傳統媒體仍然比新聞網站更有影響力。主流報紙和傳播媒體隷屬五大媒體集團：讀賣新聞、朝日新聞、日本經濟新聞（日經）、每日新聞、富士產經。讀賣和朝日有全世界最高的報紙發行量，每日分別發行620萬和360萬份。另外，日本放送協會（NHK）是世界最大的公共廣播公司之一。

自2012年以降，右翼國粹主義政治勢力掌權之後，記者往往指出大環境對他們不信任，甚至帶有敵意。在「記者俱樂部」的制度之下，只有既定的新聞機構可以參加記者會、採訪高級官員，因而促使記者自我言論審查，並且公然歧視自由新聞工作者和外國記者。

一項在2021公告實施、2024年生效的法令，限制一般大眾（包括記者）進入「國家安全相關」的國防設施和建設，包括核能電廠和軍事基地，但此法令的措辭模糊；違反者得處以二年以下有期徒刑，並且得併科200萬日元以下罰金。政府也拒絕修改「保護特定機密」相關的法律；根據此法規定，出版「非法取得」的資訊得處以十年以下有期徒刑。

印刷媒體在日本仍是主流，但在這個老年人口比例居世界之冠的國家裡，閱讀報紙的人口不斷減少，因此其未來不明。日本並未限制媒體公司同時擁有報紙和傳播管道，使得媒體高度集中在少數公司手上，也造成極其龐大的媒體集團，有些甚至有超過2,000名記者。

日本政府和企業經常對主流媒體的管理階層施壓，因此在處理貪汙、性騷擾、公衛、汙染等可能被認為敏感的議題時，媒體會高度自我審查。從2020年起，政府以防止疫情傳播為由，減少公部門記者會的出席人數，並且將公共傳媒NHK列管為全國重大危機時，必須遵照政府「指引」的組織機構之一。

日本的記者雖然有相對安全的工作環境，有些人曾經在網路上轉發被認為「誹謗」的語論，因而被政治人物控告。國粹團體也經常在社群媒體上騷擾批判政府，或報導「不愛國」議題的記者，諸如能登半島地震後救災延宕，或將福島核電廠的水稱作「處理過的輻射水」。